Primer trong sinh học là gì

Đoạn mồi là một trong tua nucleic acid [hoặc ribonucleic acid] sử dụng để gia công đoạn mở màn mang đến quy trình nhân song của DNA. Hầu không còn các DNA polymerase [enzyme xúc tác quy trình nhân đôi DNA] cấp thiết ban đầu tổng phù hợp một đoạn DNA new mà thiếu hụt primer. Vì nó chỉ gắn thêm những nucleotide vào sợi primer có sẵn theo cơ chế bổ sung cập nhật cùng với sợi khuôn.

Bạn đang xem: Đoạn mồi là gì


Primer[còn có tên call không giống làđoạn mồi] là 1 trong những sợinucleic acid[hoặcribonucleic acid] sử dụng để triển khai đoạn bắt đầu choquá trình nhân song của DNA. Hầu không còn cácDNA polymerase[enzymexúc tác quy trình nhân song DNA] chẳng thể ban đầu tổng đúng theo một quãng DNA bắt đầu nhưng mà thiếu thốn primer. Vì nó chỉ lắp các nucleotide vào tua primer tất cả sẵn theolý lẽ bửa sungvớigai khuôn.

Trong phần nhiều các quy trình sao chép DNA thoải mái và tự nhiên, mồi cơ bạn dạng đến việc tổng thích hợp DNA là sợi RNA nđính thêm. RNA này được tạo thành vì RNA polymerase, nó được loại bỏ đi và được sửa chữa bởi DNA vì DNA polymerase.

phần lớn kỹ thuậtsinh học tập phân tửliên quan đến DNA polymerase, nhưnghệ thuật xác định trình tựDNA và PCR, phải mang lại mồi. Mồi dùng cho các nghệ thuật này hay nthêm [khoảng tầm trăng tròn base], là các phân tử DNA được tổng vừa lòng nhân tạo. Cấu trúc thiệt sự của những mồi này bắt đầu bởi những 3"-hydroxylnucleosidegắn với một cái call là CPG [controlled-pore glass]. Đầu 5"-hydroxyl củanucleosideđượcdimethoxytrityl[DMT] bao trùm nhằm mục tiêu ngăn sự Thành lập chuỗi nucleotide. nhằm cấp dưỡng 1 nucleotide thì cần đào thải DMT theo cách chất hóa học, và 1 nucleotide được thêm vào. Đầu 5"-hydroxyl của nucleotide new bị khóa lại vì chưng DMT nhằm mục đích ngăn chặn sự đính tiếp tế 1 xuất xắc các nucleotide trên 1 chuỗi. Sau kia, chu trình được lặo lại so với mỗi nucleotide bởi 1 mồi. Đây chỉ với biểu lộ dễ dàng, còn quy trình thực tế thì hơi phức tạp. Vì gắng, phần nhiều các phòng thí điểm hồ hết ko sản xuất mồi bên trên chủ yếu nó.

Xem thêm: Phép Nhân Hóa Là Gì - Tìm Hiểu Chi Tiết 3 Kiểu Nhân Hóa Phổ Biến

Việc khẳng định trình từ DNA được dùng để xác minh nucleotide trong tua DNA. Pmùi hương pháp xác minh trình tự được Hotline làxác định trình tự dideoxy[giỏi có cách gọi khác làphương thức Sanger] sử dụng mồi có tác dụng marker khởi đầu đến bội nghịch ứng chuỗi.

Trong PCR, mồi được dùng để làm xác minh các phân đoạn DNA cơ mà được khuếch tán vày PCR.Chiều dàicủa mồi thường xuyên không dài thêm hơn nữa 50 nucleotide [Do DNA thường xuyên là tua song, nênchiều dàicủa chính nó được đo bằng cặp base.Chiều dàicủa DNA tua đối kháng được đo bằng base hay nucleotide], với chùng phối hợp đúng mực bắt đầu với hoàn thành phân đoạn DNA sẽ được khuếch tán. Chúnganneal[adhere] khuôn DNA nghỉ ngơi điểm mở màn cùng xong xuôi, tại đó DNA polymerase gắn thêm với bước đầu tổng thích hợp gai DNA mới.

Việc lựa chọnchiều dàimồi cùng ánh sáng nóng chảy của bọn chúng phụ thuộc vào một số nguyên do. Nhiệt độ nóng rã của mồi được quan niệm là ánh nắng mặt trời rẻ hơn nhiệt độ của mồi nhưng đã anneal khuôn DNA và cao hơn nữa ánh sáng có tác dụng mồi rời ra khỏi khuôn DNA. Nhiệt nhiệt độ tan buộc phải tăng thêm theo độ nhiều năm của mồi. Mồi thừa nthêm đã làm anneal một số địa điểm trên khuôn DNA lâu năm, dẫn cho các bản sao không đặc hiệu. Nói biện pháp khác,chiều dàicủa mồi bị giới hạn vì ánh sáng có tác dụng rét chảy nó. Nhiệt nhiệt độ tan quá cao, tức là trên 80°C, có thể gây ra một trong những vấn đề vày DNA poluymerase không nhiều chuyển động nghỉ ngơi ánh nắng mặt trời này.Chiều dàitối ưu của mồi vào mức 30 cho 40 nucleotide cùng với ánh nắng mặt trời nóng rã vào thời gian 60°C đến 75°C. Có một số trong những phương pháp để tínhnhệit độ nóng chảy[TM] của mồi. [A, G, C cùng T tương ứng là số nucleotide của mồi.là độ đậm đặc Na+trong PCR]

Pmùi hương pháp "GC": Nkhô hanh và đơn giản dễ dàng, với mồi nhiều năm bên trên 13 nucleotide.displaystyle T_M=64+frac G+C-16.4A+G+C+T
Phương thơm pháp "kiểm soát và điều chỉnh bởi muối": đúng chuẩn hơn GC, với mồi dài ra hơn nữa 13 nucleotide.displaystyle T_M=100.5+41*frac C+GA+C+G+T-frac 820A+C+G+T*16.6*log_10[]
Base-stacking calculation: đúng đắn nhất, tuy thế phức tạp

displaystyle T_M=frac Delta Hfrac kcalMol*^oCDelta S+Rln[frac primer2]-273.15^oC

trong đódisplaystyle Delta H
làenthalpycủa liên tưởng base stacking điều chỉnh cho những yếu tố mở đầu vòng xoắn [helix]displaystyle Delta S
làentropycủa base stacking kiểm soát và điều chỉnh cho các nhân tố khởi đầu helix và kiểm soát và điều chỉnh nồng độ muối hạt mang đến emtropydisplaystyle R
is theuniversal gas constantdisplaystyle left[frac 1.987CalMol*^oC ight]

Cũng vậy, mồi ko anneal thuận lợi cùng với chính nó cùng các chiếc thuộc nhiều loại cùng với nó, Ra đời cần những loop hoặc kẹp tóc trong quá trình. Vấn đề này làm cản ngăn bài toán anneal khuôn DNA. Tuy nhiên, càc kẹp tóc nhỏ tuổi thường xuyên bắt buộc tách khỏi.

Đôi khi cũng sử dụngmồi phân giải. Các mồi này là một trong các thành phần hỗn hợp mồi như thể nhau, tuy vậy không xác định. Chúng có thể phù hợp nếugenenhư thể nhau được khuếch đại tự cácsinc vậtkhác biệt. Có những biện pháp sử dụng khác so với mồi phân giải là lúc mồi thiết kế dựa vàotrình từ bỏ protein. Một sốcodonkhông giống nhau hoàn toàn có thể mã hóa đến mộtamino acid. Vì vậy trình từ của mồi tương xứng vớiamino acidisoleucinehoàn toàn có thể là "ATH", trong các số đó A vắt choadenine, T chothymine, cùng Hadenine,thymine, hoặccytosine. [Xemmã di truyềntrong những bài xích sau này vềcodon] Sử dụng mồi phân giải rất có thể có tác dụng bớt tính sệt hiệu của quá trình khuếch tán PCE. Vấn đề có thể được xử lý từng phần bằng cách sử dụngtouchdown PCR.

Video liên quan

Chủ Đề